Макото Юки поступает в студенческое общежитие частной академии Гэккокан. Вскоре на него нападает монстр, называемый Тенью, что пробуждает в нём способность вызывать Персоны - сверхъестественные сущности. Члены секретного студенческого клуба SEES, занимающегося борьбой с Тенями, замечают в Макото необычный потенциал и приглашают его присоединиться к ним. Макото, изначально отстранённый и равнодушный, соглашается без энтузиазма, но постепенно начинает чувствовать связь с новыми товарищами.

Пятнадцатилетний пилот Клаус Барка и его навигатор Лави Хэд занимаются доставкой курьерских писем. Эта работа обеспечивает им стабильный заработок и не предполагает серьезных рисков. В ходе очередного задания они встречают умирающего человека, который просит их выполнить опасную миссию - доставить девочку на определенную планету. Несмотря на то, что Клаус и Лави обычно избегают подобных поручений, они соглашаются. Пилот и навигатор отправляются на поиски девочки. После того как они находят ее,