Сюжет аниме "Доктор Стоун: Каменные войны" разворачивается после необъяснимого астрономического явления, превратившего всех живых существ на планете в каменные статуи. Главный герой, старшеклассник Тайдзю Оки, оказывается одним из первых, кто возвращается к человеческому облику. В момент окаменения он признавался в любви девушке, которая осталась статуей. Тайдзю решает найти её и других выживших, чтобы восстановить человечество. Вскоре Тайдзю встречает своего школьного друга Сэнку